并下令让部众原地调整休息，其部众逐渐恢复平静，秃发傉檀翻身上马，集合部众迎战，大胜吕纂，斩杀两千余人。
吕纂逃回姑臧，并不甘心，再次领兵攻击北凉国都张掖，秃发傉檀得报，便率领一万骑兵乘虚奔袭姑臧，攻破外城，吕纂只得率军回援，秃发傉檀闻讯掠夺人口八千户而退。
本欲建功立业，大展宏图的吕纂接连败北，便对复兴后凉之事彻底灰心，一天到晚饮酒无度，不理朝政，群臣劝谏，其表面同意痛改前非，但继续我行我素，以至后凉国政荒废，朝纲松弛，本就虚弱的国力，更是雪上加霜。
公元401年2月，宗室吕超见西秦国主乞伏乾归败于后秦姚兴，便自作主张，带兵讨伐西秦。吕纂得知后，便命吕超速回姑臧，刚刚豪饮过后的吕纂见到吕超回朝请罪，破口大骂道:“汝自恃能力超凡，而不听朕之号令，朕恨不能将汝杀之!”
吕纂实际并无诛杀吕超之意，仍命其参加午宴，并待之如常。但说者无心，听者有意，吕超心中又想起当年劝说吕绍诛杀吕纂一事，更是惶恐万分。
午宴结束，吕纂心情平复，便带吕超等宗室大臣乘车游览王宫，行至一处洼地，车轮陷入泥中，吕纂只好带众臣下车，等卫兵将车推出，再继续游览，而吕超一路思忱如何保住性命之事，见有卫兵为方便推车，将佩剑放在地上，赶忙捡起剑，将吕纂刺死。
吕纂被刺身亡，宫中大乱，卫兵围攻吕超，吕超奔逃不止，就在这时，有宗室大臣数人喝止宫中卫士，纷纷称曰：“事已至此，吕纂本就弑君篡位，命该如此，不如吾等再立新君！”
众卫士见吕氏宗族之人都不再追究吕超弑君之事，便也停止追击，不久，众宗室大臣拥戴吕超之兄吕隆继承后凉国主之位。
就在后凉国中接连发生骨肉相残的短短两年内，刚刚建国的北凉，再生重大变故。
若知北凉国中发生何等大事，请看下章。