他们大多信仰佛教，无法接受突然的信仰转变，中华文化历史悠久，而且又习惯了以天朝自居，不易接受外来文化，更不用说是要放弃自己的文化，这通常是被看作“背叛”老祖宗的举动，是要遭天谴的。况且这些初期华人来到菲律宾只是为了谋生，并不打算久居，因此也就不会理会西班牙的这种教化。
为了顺利推行教化，西班牙人推出法令，不允许华人与菲律宾人杂居，而且还以纳税优待和就业便利吸引华人。为了取得与菲民杂居权利以及方便谋生，一部分华人改信天主教。但这也只是少数，西班牙对华人的教化以失败告终。由此西班牙将在菲额华人视为眼中钉，为后来西班牙在菲进行排华运动埋下了引线。文化上的差异，使得土著菲人对华人存在着敌视情绪。华人看不起土著菲人，认为他们是未开化的、没文化的人，而菲人在西班牙的教化下也接受了西班牙对华人的仇视态度