李莫愁因按捺不住古墓的淡泊生活，不肯立终身留在古墓的誓言，而将她逐出师门。后来李莫愁得罪了当时已经疯癫的西毒欧阳锋，逃回终南山，于是出墓接应，中了敌人的暗算。虽然吃亏，仍接了李莫愁回来。
后来来欧阳锋强攻入墓，抵挡不住，险些便要放断龙石与他同归于尽，幸得在危急之际发动机关，又突然发出金针。欧阳锋猝不及防，为金针所伤，麻痒难当，乘势点了他的穴道，制得他动弹不得。只可惜欧阳锋早已练成九阴假经，懂得经脉逆行, 不惧任何点穴, 突起发难，中了他的毒手, 受了重伤。
受伤之后，搬了居室，远离寒玉床。至死都不肯说欧阳锋的名字, 希望小龙女别有报仇之念。孙婆婆问她是不是欧阳锋，她总是摇头，微笑了一下，便此断气了。遗体安葬在活死人墓的石棺中。
临死前，预计到李莫愁会强抢玉女心经，于是在古墓的机关放了玉蜂针，并留信交代在小龙女十八岁生日的时候，正式成为第三代掌门人。
李明启版孙婆婆
如果李莫愁不痛改前非，小龙女会以掌门身份清理门户。不过此举只增强李莫愁对玉女心经的野心, 间接促成李莫愁对小龙女和杨过的迫害。
小龙女(第三代掌门)时期
李莫愁贪念尘世，逃出古墓，为古墓派闯出名声，曾与陆展元相恋，后来陆展元移情于“农夫”武三通的义女何沅君，因而令李莫愁身心大受打击而性情大变，成为杀人如麻的女魔头。先后收洪凌波和被她灭门的陆无双为徒, 二人没有回古墓。
刘亦菲版小龙女
杨过拜入全真派门下，但却受尽同门侮辱欺凌, 因打伤同门师兄而急忙逃走，得终南山古墓里居住的孙婆婆救出，而孙婆婆也在与全真派冲突中，不幸被郝大通误杀，在孙婆婆的恳请下，小龙女接纳了杨过，杨过拜小龙女为师。其后数年，杨过与小龙女同住古墓之内，与之渐生情愫。
李莫愁及洪凌波趁小龙女练玉女心经受重伤时, 进入古墓向师徒二人施袭, 欲强抢玉女心经, 折磨杨过和小龙女。小龙女放下断龙石欲与李莫愁同归於尽, 最后四人游泳离开古墓。在此期间, 陆无双逃脱，并带走《五毒秘传》。在途中结识了杨过，一起逃避李莫愁的追赶。
杨过和小龙女相爱历经坎坷，终于在一起。二人在中神通王重阳画像前拜堂成亲, 回到古墓办婚礼, 小龙女用林朝英的嫁妆打扮成新娘。李莫愁趁小龙女疗伤时用毒掌伤她, 又被郭
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