考虑起了葡萄牙人投降的建议。
3月5日，在最后一次战斗失利后，饥饿的葡萄牙人最终屈服于现实，他们打着白旗出城。在与儒尼奥尔少校商定不得随意杀人并强迫改信之后，葡萄牙人的军队最终列队而出，然后挨个上缴了武器，换取了一些赖以为生的食品。
第二天上午，已在香山县招募了一批新兵的第十一师三千余人，在师长博格丹的带领下列队进城，宣示了这座商贸港口的易主——葡萄牙人苦心经营多年的中国落脚点，没有落在荷兰人的手里、也没有被英国人夺走，而是被东岸人攻破。
入城后的东岸军队遵守前约，没有展开屠城等报复行动，只是小规模的抢劫、强奸却怎么也避免不了。好在宪兵队还算给力，田上尉在看到闹得过火时就会上前逮捕几个人，然后将其送到城外与军夫们一起做上一两个月的苦力，以示惩罚。
澳门城内核心的总督府、仓库、修船厂、大型商铺、银行（当时叫货币兑换商）等设施，被儒尼奥尔少校亲率的挺身队占据，他们将所有葡萄牙军人驱赶到城外，让他们自己搭建战俘营，然后由新军第十师孙守正部看管。
而作为投降的好处之一，一支由郝尧同组织的运粮队开进了澳门城，解了两万余居民的燃眉之急，顺便也让郝尧同这些人发笔小财，毕竟他们在战争期间没有功劳也有苦劳。当然澳门城内不是所有人都买得起粮食的，长达三个月的围城已经耗干了大部分底层民众的积储，因此这些人此时只能望粮兴叹。不过这并不意味着他们可以绝望了，事实上儒尼奥尔少校还给了他们一个机会，即前往海珠岛上替东岸人兴建商站——唔，装备了二十多门大炮的商站——码头、公路和其他一些附属建筑，那里正缺劳动力呢。当然了，在登船前去干苦力之前，东岸人会仁慈地允许他们吃几天饱饭。
对了，在这三个月内，东岸人也不光是在打仗。事实上以邵曙光为首的交涉团队，就频繁来往于广州和香山之间，且随着战争的进程而最终取得了在海珠岛上修建贸易商站的权利。这个商站将直接面向广州城，进口生丝、茶叶、锦缎、瓷器、蔗糖等各类商品，同时向其转售产自南洋的檀香木、香料、铅、锡、染料以及东岸自产的铁器、纺织品、黑珍珠、皮革、肥皂等物事，利润应当极其丰厚。据悉，这项生意今后将由台湾银行所独揽，前提是该行接受政府的新一轮注资及股权调整。
3月8日，此战缴获的战利品差不多也最终统计了出来：总督府金库内尚有价值超过六十万明国库平银的金银币、银条
…。。