是挑选合适的人才，像颜思齐、李国助、杨天生、郑芝豹、陈衷纪、甘辉等长期在日本活动的海盗商人，他们打头阵具有天然的优势。另外南居益、熊文灿、商周祚、蒋德璟、沈有容、郑芝龙等海战专家也被委以重任，加上西洋军事人员和海事学院的学生，明朝已经具有深厚的人才储备。
跨海作战的第二个关键因素是资金，此时明朝已经控制了马六甲海峡以东的航线，并与英格兰、荷兰、葡萄牙联手在印度获得了巨大的原材料市场，丰厚的贸易利润让朱由校有足够的信心和日本打一场二十年的消耗战。
不过要单算经济账，征服日本是亏本的，这也导致朝廷内部的纷争不断，保守派担心一旦失败将重蹈隋炀帝三征高丽的覆辙，届时不但明朝在北方的领土要丢失，甚至会面临沿海的压力。
面对这些老臣的苦口婆心，朱由校一改平日的乾坤独断，耐心的动之以情晓之以理，最后搬出了太祖朱元璋的典故。当年朱元璋曾派遣使臣带着国书出使日本，要求他们朝贡，并解决倭寇的问题，结果日本不仅撕毁了国书，还砍下使者的首级，表明要与明朝分庭抗礼的态度。
当时日本的摄政大臣怀良亲王之所以敢跟明朝叫板，是因为他觉得中原王朝是大陆帝国，从未有征服海上岛国的记录，更没有大规模海战的经验。虽然日本尚且没有战胜明朝的实力，但他断定明朝不会像蒙古远征军那样冒进，这才有恃无恐。
这种思维一直持续到德川幕府时代，他们从不担心明朝会实施跨海登陆作战，这才实行闭关锁国的政策，将全部精力用在吞并地方大名和镇压天主教徒起义。
当朱由校慷慨激昂的说完这段历史后，突然愤怒的拨出拔剑，将龙案的一角劈断，然后剑锋指向众人说道
“辱我祖先，斩我使臣，杀我百姓，抢我财富，是可忍孰不可忍！日本虽然贫瘠，却是我朝的隐患，朕准备用十年来征服日本，彻底消除东面的威胁，然后海军南下控制马六甲海峡，禁止西洋人进入南洋活动。同时陆军继续往西扩张，用我们的剑为我们的犁争取更多的土地。”
朱由校的愤怒惊呆了在场的所有军政要员和智囊团，颜思齐为代表的海外商人只想控制海疆发展贸易，南居益为代表的海军势力是想守卫大明海疆，黄克缵为代表的传统保守势力则想对外宣扬国威，而七十多岁高龄的黄克缵早已没了争强好胜的雄心，只盼着哪天自己的孙女黄梦萱由侍妾变为后宫娘娘，自己也好混个太国丈的身份衣锦还乡。