天文学、物理学、数学、律历都是穷源探委的应用学科，钟表、望远镜、起重机、乐器莫不精工绝伦，荷戈之士配上火枪巨炮皆是万人敌。在科技的推动下，欧洲弹丸之国的商船遍贾世界，积累了大量的原始资本，其富庶程度丝毫不逊色于中原地区。
虽然朱宗元过分的夸大了欧洲的实力，但假以时日明朝被欧洲超越并不是痴人说梦，而且这种端倪在征服日本的过程中已经有所体现。当初约瑟夫临阵倒戈，仅用九艘战船就封锁了江户外海，炮击德川家光的守军，协助明军顺利的登陆。事后南居益和洪承畴均对此进行反思，认为英格兰不过是方寸之地，其战力却不在大明皇家海军之下。他们的航海天赋出类拔萃，应当主动向其学习造船和铸炮技术，师夷长技以自强。
这场争论由于双方势均力敌，谁也没能占据上风，最后只能求助小皇帝主持公道。这些年朱由校跟着方从哲、叶向高学习，早就成为一名和稀泥的高手，他假装很不情愿的将八股取士改为申论和行政能力测试，但强调考试必须以儒家经典为主，欧洲学科为辅，综合考察学生的能力。另外恢复汉朝时期的察举制，由皇帝根据具体情况破格选拨人才，借此打破士大夫阶层对官僚集团的垄断，让寒门子弟能够有机会施展才华。
这种文理并行的选才制度确立以后，大明王朝迅速补充了许多工科人才，瞿汝夔、李之藻、杨廷筠这些开明士绅逐渐进入大明权力的中心，在他们的带领下，明朝的知识份子开始重视对物质世界的探索，已经走在了西方的前列。