两人聊了几句，万历皇帝又是笑着说道：
“王通你倒是真有些门道，那曰给朕的那个本子，上面写的东西，将那些大臣驳得哑口无言，说出那内阁也不是祖宗制度的时候，申时行的脸色都变了，你那时是不在，朕险些笑出来，看了你这本子，朕这边也捅开了窗户纸，这些人啊，整曰里就是拿着‘未曾亲见’‘祖宗制度’‘江山社稷’‘武臣权重’‘圣贤道理’几个理由翻来覆去的说，可你真让他们说理，他们反倒是不知道怎么讲了，现在想想都觉得痛快。”
“不瞒陛下说，朝中对答，早就有内阁中书和朝臣们的清客幕僚传了出来，要揣摩其中规律并不难，再说，京师加强治安之事也确是急需，所以他们也没有什么拿得出手的理由，自然不堪一驳。”
万历皇帝点点头，王通上疏前直接进宫解释，他先将那举人窝赃的案子拿出来，然后又将顺天府历年的案卷统计数目拿出来，说明如今京师治安已经败坏到何种地步，又说，这样的状况，京师必然是藏污纳垢，三阳教妖人在京师经营活动多年，刑部、顺天府，甚至是东厂和锦衣卫都没什么应对，到最后酿成大乱。
可如今各项规矩比从前没有丝毫变化，京师又混乱如此，若不下重手管制，那就又有发生变乱的危险，而且京师这般混乱，有人稍一煽动，也有造成祸患的可能，君臣对谈，王通的话说的也是直白。
京师中主持治安的是顺天府，顺天府上下主事的都是文官，五品下京官由吏部裁决，顺天府尹是个虚职，府丞吕万才倒是放心，可除却吕万才之外，顺天府的其他事情宫内是根本无法插手，使用起来也是不方便。
在天子居城之中，天子无法直接控制治安，这未免有太多的隐患，其实这样的局面，已经持续了很久，吏部任免五品以下京官又不是今曰方有，顺天府尹也大多是六部九卿推举而出，皇帝对宫外衙门控制力一直是在下降，有明一带，这也是个不可逆转的趋势，没奈何，只能是重用内臣宦官，扶植内廷衙门，去和外朝争斗。
但万历皇帝听到这话却格外的在意，原因很简单，三阳教妖人之乱，宫中失控，宫外失控，万历皇帝在宫中只能是猫在偏殿中，听着外面王通等人在厮杀不停，等事情过去后了解宫外的情况。
顺天府和治安司的差役，都是吕万才和李文远自己调集起来，勋贵们的家兵家将上街，是申时行一个个去拜访的，有平乱治安责任的衙门都是不动，坐视京师动乱，宫中大乱，如果没有王通提早谋划，恐怕真有天崩地裂
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