郑成功见劝不动父亲,又想起商毅信中所说的话,于是连夜返回金门,静观事态的变化。并给郑芝龙留下一封书信道：“从来父教子以忠,未闻教子以贰。今父不听儿言,后倘有不测,儿只有缟素而已。”
第二天郑芝龙不见了郑成功,看到了书信,也不由大骂郑成功是个逆子,满纸狂悖之言,但这时郑成功己经返回金门,郑芝龙只得带着幼子郑渡,五百士兵,和洪承畴一起出发,前往福州。
到了福州之后,一开始勒克德浑还对郑芝龙盛情招待,与郑芝龙折箭立誓。郑芝龙还以为得计,也完全放下心来。连带来的五百士兵也都遣散。
那知就在第三天夜里,勒克德浑突然宣布拔营返回北京,同时命令郑芝龙随军北上。郑芝龙大吃一惊,这才知道自已中计,但这时己被困福州身边只有十几名从人,根本就无力反抗,尽管郑芝龙不甘心束手就擒,最后还努力一把,对勒克德浑道：“北上面君,本芝龙本愿,但子弟多不肖,今拥兵海上,倘有不测,奈何？”还想借自己的兵力威胁一下勒克德浑,作最一搏。
但清军对此早有定计,勒克德浑的回答是：“此与尔无关,亦非吾所虑也。”同拿来纸笔,让郑芝龙当面写了几封信,用以劝降郑氏军队的主要将领。而这时的郑芝龙己为砧上的任人宰割的肉,只能按照勒克德浑的要求,给自已的亲属、将领写信。让他们都到福州来投降清军。
郑成功在金门收接到郑芝龙的书信后,当即回信拒绝向清军投降,道：“今既不能匡君于难,致宗社堕地,何忍背恩求生,反颜他事乎？大人不顾大义,不念宗祠,投身虎口,事未可知。赵武、伍员之事,古人每图其大者,唯大人努力自爱,勿以成功为念。”
与郑成功同样拒绝投降清军的,还是踞守厦门中左所的郑彩,金门的郑鸿逵以及南澳的陈豹等人。但绝大多数的郑氏将领、包括郑芝豹、施天福、洪习山、黄廷、施郎等人都放下武器,带着军队,向清军投降,庞大的郑家私人军队,在旦夕之间便瓦解了。而最后总计投降清军的军队人数,竞达到了十一万三千余人,战船近六百余艘。加上清军前期在进攻江西、福建收降的南明军队,竟然一下子收降了各部明军十五万余人。
而在此期间,清军也攻占了福建的最后一地泉州府,并且还杀入了郑芝龙的老家安平,然后四处抢掠,郑芝龙纵横海上近二十年,积攒下来可以敌国的巨额财富,也被清军哄抢一空。
郑芝龙己经被清军严密看管,软禁起来,福建也几乎全都被清军占领
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