经历过伯大尼支部基地入侵事件，以及第三使徒突破收容事件之後，两年时间匆匆流过，EVA世界来到了2014年，也就是使徒们「真正开始进攻」的年份。
这期间除了橙子在暗地里疯狂搞事之外，青子在NERV本部作为主管MAGI
人工智慧的科学家十分称职，为「深思」大模型完成了数次升级，针对不同工作开发了不同的版本，甚至连基地内部的交通工具都变成了完全自动驾驶，得到了本部员工的一致好评。
当然，这些都是表面上的，青子在给这些智能系统埋设後门代码的时候是一点都没手软，或者说只要她想，目前基地内所有自动设施都会立刻停摆。
橙子的伯大尼基地那边，终於开始进行ADAMS要素分离工作，大致上将其分割为骨骼和核心两个部分。
和青子这边一开始估计的不错，ADAMS的骨骼将被制作成NHG星舰的龙骨和主要功能中枢，而装载有其灵魂的核心将被制作为「ADAMS的容器（器官）」，也就是身为「主人」的九号机。
但由於目前用纯核心制作EVA的技术还不成熟，所以工程暂时被搁置了，ADAMS的核心和灵魂则被封存了起来。
伯大尼基地花费了九牛二虎之力将整个海底基地修复完成，结果没开心几天，就发现作为王牌之一的五号机α的驾驶员偷偷跑路了。
支部主管大发雷霆，打电话质问真希波为什麽逃跑，结果真希波的理由也很「充分」：「我是来当EVA驾驶员拯救人类的，不是每天在工地里搬砖打灰的建筑工人！」
这下子把大家都搞的哑口无言，因为上海支部给真希波开出的待遇是真的好，根本就不是伯大尼基地这种孤零零地建在北冰洋里的机构可比的。
五号机失去驾驶员成为了既定事实，虽然很遗憾，但主管明白再生气下去也没什麽用了，而是第一时间联系了委员会，要求委员会为他们派遣新的驾驶员。
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这个时候就轮到青子之前在欧洲埋下的「暗桩」们行动的时候了，培育和训练明日香的教育早就完全陷入了青子的魔术控制之中，这麽多年以来一直都没有发现。
所以青子在得到了格蕾、阿尔托莉雅、摩根三人的同意之後，安排格蕾成为了新的驾驶员人选。
在这个培养机构里，格蕾变成了自小失去父母的孤儿，被培养机构从福利院发现，并作为明日香
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