反L力场发生器的成功运作，让飞机上所有的乘客都松了一口气，不由得开始期待起了即将抵达的上海支部的生活。
这些运输机上的所有人，都将会被NERV上海支部所接收，因为在这人类随时可能灭绝的末世之中，继续培养更多的高端人才也成了奢望，那麽原本就在本部工作多年的人员，就是最宝贵的人才。
如果这些运输机上庆幸自己劫後余生的人们，但凡看一眼此时的地面的话，
他们一定会被这幅景象所震惊：
所有居住大地之上，没有拿到通往避难所资格的人们，此刻都已经因为这不断蔓延的赤红色大地而失去了自身的形体，顷刻之间化为了名为LCL的橙色液体。
但这还不是结束，猩红色的核化大地上，开始一个接一个地涌现出和EVA初号机造型十分相似的红色巨人，这些巨人拥有半透明的身躯，从外侧能看到其内部的神经脉络、骨骼，还有胸口处圆润的核心。
它们缓缓地向着同一个方向前进，那是第三新东京市所在的地方，也是地球众生之母、莉莉丝所在的地方。
六号机开始从近地轨道的初号机旁降落，进入大气层，渐渐接近NERV本部所在区域。
此刻NERV本部的一切设施都已经为他所敞开，再也没有一丝阻挠。
顺着通往最终教条的垂直通道缓缓降落，直到抵达一片漆黑的障壁之前。
但六号机并没有停止，随着靠近脚下的障壁，这些奇异的物质随着的靠近开始有规律地挪动着，分裂成一块块砖块，按照特定的螺旋移动的方向，如同水中的漩涡一般，张开了一条通道。
现在，亿万年之後，拥有「真神」之称的EVA终於抵达了莉莉丝的所在地，被人类称之为最终教条的空间。
巨大的白色半身巨人被钉死在猩红色的十字架上，沉默不语，EVA六号机漂浮到莉莉丝的身前，双手握紧了插在白色巨人胸口处的朗基努斯之枪，然後果断地用力一拔，就让这根插在莉莉丝身体许久的「刺」，被拔了出来。
随看朗基努斯之枪的拔出，白色的莉莉丝立刻就从腰部生长出了双腿。
莉莉丝双手从十字架上的钉桩上滑落，脸上的七眼面具也跌落到了水池中的LCL里，掀起了阵阵浪花。
如果这时候有任何NERV本部的员工看到这一幕，那麽最令他震惊的肯定不是莉莉丝的「复活」，而是人类之母的脸颊。
那脸颊居然逐渐变成了
…。。