汉斯在信中提出让巴达维亚派出武装船只和人员加强大员港防御实力的要求，则直接被科恩无视了——不先把纳土纳岛的事情解决，怎么敢放心向大员那边派人派船过去？
还有一件事科恩也没有忘记，那就是帮斯派克斯洗刷罪名。由于范隆根的归来，纳土纳岛一战终于有了第二名指挥官的证言，而这也正是证实斯派克斯所说的状况是否属实的最有力证据。为此公司董事会召开了为期两天的听证会，对范隆根进行了详细的盘问，以确定他所说的情况与斯派克斯所讲的完全一致。
这个时候范隆根作为一个长期在海上航行的船长，他的航海日志就派上了大用场。在这本日志中范隆根详细记述了当时在纳土纳岛与岛上武装交战的全过程，而这也成为了把斯派克斯从畏战、指挥失职、战场脱逃等罪名中拯救出来的有力凭证;。
不过即便是洗脱了这些莫须有的罪名，斯派克斯也依然没办法立刻获得重新启用的机会。就算他没有那些罪名，但纳土纳岛的惨败依然是不争的事实。两名军事主官之一的布劳沃已经战死沙场，无法追究其责任，这个锅也只能由他来背了。至于范隆根，他的身份还仅仅只是商船船队的指挥官，能够参加军事行动已经算是不易，也不会有谁去追究他的指挥责任。
范迪门接手了东印度公司海上武装的指挥官职务之后，便开始着手准备攻打纳土纳岛的事宜。有鉴于前次的失败经验，东印度公司想要收复纳土纳群岛，所做的准备工作就必须得比之前更为充分才行。上次出动的兵力显然并不足以撼动对手在岛上部署的防御阵地，考虑到对方的海船全部没见着影子，有可能在岛上驻守的还并非主力，那么再次出征的时候就必须把撞上对方主力部队的可能性考虑进去，再仅仅只是上次出动的那点兵力显然是不够稳妥。
范迪门根据前次的交战状况进行了估算，认为至少要派出三千人左右的兵力，才能保证在岛上的交战中以火力压制住对手取得主动，然而要调集到他所需的这么多兵力，对东印度公司来说也绝非易事。
东印度公司在整个远东地区的武装人员有将近万人，这绝对是一个很有威慑力的数字，不过这些人员分散部署在公司的数十个殖民地，短时间内是没法完成快速聚集的。这种弊端的根源还是在于殖民地分布太过分散，没办法集中部署兵力，类似纳土纳岛失守之前，岛上也有一批武装人员和训练的土著协从军，但很显然这点象征性的防御力量并不足以阻挡对手的进攻。
巴达维亚周边地区是东印度公司重点布
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